موضوع فارسی :شبیه سازی دینامیک مولکولی از غشاهای زیستی و پروتئین های غشای با استفاده از الگوریتم نمونه کنفورماسیونی افزایش
موضوع انگلیسی :<!--StartFragment -->
Molecular dynamics simulations of biological membranes and membrane proteins using enhanced conformational sampling algorithms☆
تعداد صفحه :17
فرمت فایل :PDF
سال انتشار :2015
زبان مقاله : انگلیسی
در این مقاله روش های مختلف افزایش یافته نمونه ساختاری و مدل های حلال / غشاء صریح و روشن / ضمنی، و همچنین برنامه های اخیر خود را به کاوش در ساختار و دینامیک غشاء و پروتئین های غشای. شبیه سازی دینامیک مولکولی تبدیل به یک ابزار ضروری برای بررسی مشکلات بیولوژیکی و موفقیت خود را متکی بر مدلهای مولکولی مناسب همراه با EF فی کافی روش های نمونه گیری ساختاری. نمایندگی ضمنی از محیط حلال / غشاء تقریب منطقی به مدل تمام اتم صریح و روشن، توجه به تعادل هزینه های محاسباتی و دقت شبیه سازی است. مدل های ضمنی می تواند به راحتی با ماکت تبادل روش دینامیک مولکولی ترکیب برای کشف یک فضای ساختاری گسترده تر از یک پروتئین است. سایر مدل مولکولی و روش های نمونه گیری ساختاری افزایش نیز بهاختصار مورد بحث است. به عنوان نمونه برنامه، ما مطالعات شبیه سازی اخیر glycophorin A، فسفات-lamban، پروتئین پیش ساز آمیلوئید، و دو لایه لیپیدی مخلوط معرفی و بحث در مورد دقت و بهره وری از هر مدل شبیه سازی و روش. پروتئین غشایی: این مقاله بخشی از یک موضوع خاص تحت عنوان است. ویراستاران مهمان: J.C. Gumbart و سرگئی نوسکوف.
© 2015 منتشر شده توسط الزویر B.V.
دانلود مقاله ISI شبیه سازی دینامیک مولکولی از غشاهای زیستی و پروتئین های غشای با استفاده از الگوریتم نمونه کنفورماسیونی افزایش