اس فایل

مرجع دانلود فایل ,تحقیق , پروژه , پایان نامه , فایل فلش گوشی

اس فایل

مرجع دانلود فایل ,تحقیق , پروژه , پایان نامه , فایل فلش گوشی

دانلود مقاله ISI شبیه سازی دینامیک مولکولی از غشاهای زیستی و پروتئین های غشای با استفاده از الگوریتم نمونه کنفورماسیونی افزایش

اختصاصی از اس فایل دانلود مقاله ISI شبیه سازی دینامیک مولکولی از غشاهای زیستی و پروتئین های غشای با استفاده از الگوریتم نمونه کنفورماسیونی افزایش دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

موضوع فارسی :شبیه سازی دینامیک مولکولی از غشاهای زیستی و پروتئین های غشای با استفاده از الگوریتم نمونه کنفورماسیونی افزایش

موضوع انگلیسی :<!--StartFragment -->

Molecular dynamics simulations of biological membranes and membrane proteins using enhanced conformational sampling algorithms

تعداد صفحه :17

فرمت فایل :PDF

سال انتشار :2015

زبان مقاله : انگلیسی

 

در این مقاله روش های مختلف افزایش یافته نمونه ساختاری و مدل های حلال / غشاء صریح و روشن / ضمنی، و همچنین برنامه های اخیر خود را به کاوش در ساختار و دینامیک غشاء و پروتئین های غشای. شبیه سازی دینامیک مولکولی تبدیل به یک ابزار ضروری برای بررسی مشکلات بیولوژیکی و موفقیت خود را متکی بر مدلهای مولکولی مناسب همراه با EF فی کافی روش های نمونه گیری ساختاری. نمایندگی ضمنی از محیط حلال / غشاء تقریب منطقی به مدل تمام اتم صریح و روشن، توجه به تعادل هزینه های محاسباتی و دقت شبیه سازی است. مدل های ضمنی می تواند به راحتی با ماکت تبادل روش دینامیک مولکولی ترکیب برای کشف یک فضای ساختاری گسترده تر از یک پروتئین است. سایر مدل مولکولی و روش های نمونه گیری ساختاری افزایش نیز بهاختصار مورد بحث است. به عنوان نمونه برنامه، ما مطالعات شبیه سازی اخیر glycophorin A، فسفات-lamban، پروتئین پیش ساز آمیلوئید، و دو لایه لیپیدی مخلوط معرفی و بحث در مورد دقت و بهره وری از هر مدل شبیه سازی و روش. پروتئین غشایی: این مقاله بخشی از یک موضوع خاص تحت عنوان است. ویراستاران مهمان: J.C. Gumbart و سرگئی نوسکوف.
© 2015 منتشر شده توسط الزویر B.V.


دانلود با لینک مستقیم


دانلود مقاله ISI شبیه سازی دینامیک مولکولی از غشاهای زیستی و پروتئین های غشای با استفاده از الگوریتم نمونه کنفورماسیونی افزایش

دانلود مقاله ISI زمان موازی الگوریتم تعامل جنبشی مولکولی برای CPU / GPU کامپیوتر

اختصاصی از اس فایل دانلود مقاله ISI زمان موازی الگوریتم تعامل جنبشی مولکولی برای CPU / GPU کامپیوتر دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

موضوع فارسی : زمان موازی الگوریتم تعامل جنبشی مولکولی برای CPU / GPU کامپیوتر

موضوع انگلیسی : Time parallel kinetic-molecular interaction algorithm for CPU/GPU computers

تعداد صفحه : 8

فرمت فایل :pdf

سال انتشار : 2012

زبان مقاله : انگلیسی

چکیده

موازی در زمان، روش تعامل چند مقیاسی است برای سیستم های در مقیاس مولکولی به وسیله متغیرهای تصادفی وابسته به زمان است که اطاعت دینامیک لانگوین توصیف معرفی شده است. در بزرگتر، مقیاس جنبشی، سیستم توسط یک تابع توزیع احتمال که اطاعت یک معادله فوکر-پلانک مرتبط است. فرض بر این است که مقدار اصلی مورد علاقه در مقیاس جنبشی تابع توزیع احتمال است، و این که مقیاس زمانی مولکولی بسیار کوچکتر از
کسانی که علاقه در مقیاس جنبشی است. روش تعامل چند مقیاسی کلی RE تکراری predictor- پالایش فی است
الگوریتم اصلاح شبیه به روش parareal، اما با مدل های فیزیکی دی مختلف FF مورد استفاده در هر مرحله. در مرحله پیش بینی، یک FF دی جزئی حل معادله erential استفاده شده است برای به دست آوردن تخمین می زند از تابع توزیع احتمال در یک زیربخش از یک فاصله زمانی. در زمان شروع هر فاصله فرعی، پیش بینی تابع توزیع احتمال استفاده شده است به مقداردهی اولیه مجموعه ای از متغیرهای تصادفی که پس از آن به جلو در زمان تکامل یافته توسط
دینامیک لانگوین. برآورد تابع توزیع احتمال از تحول زمانی لانژون در ساخت
مقیاس مولکولی و نسبت به از مقیاس جنبشی معادله فوکر-پلانک برای تعیین اینکه آیا بیشتر
تکرار شونده پالایش آتش مورد نیاز است. محاسبات در مقیاس مولکولی در پردازنده گرافیکی بسیار موازی اجرا
واحد، در حالی که شبیه سازی در مقیاس جنبشی در حال اجرا است در واحد پردازش مرکزی.عملکرد این الگوریتم بر روی مدل دمبل ساده از پلیمر جریان آزمایش

کلمات کلیدی: الگوریتم چند مقیاسی، الگوریتم multiphysics، معادله جنبشی


دانلود با لینک مستقیم


دانلود مقاله ISI زمان موازی الگوریتم تعامل جنبشی مولکولی برای CPU / GPU کامپیوتر

اصول ژنتیک مولکولی

اختصاصی از اس فایل اصول ژنتیک مولکولی دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

 

 

 

شامل بحث های زیر :

مواد ژنتیکی

کروموزوم ها

مشخصات کلی کروموزوم ها

وجود باندهای روی کروموزوم

کاریوتیپ

کاریوتیپ نرمال

کاریوتیپ غیر طبیعی: کروموزوم های غیر طبیعی

کایمریسم

آنرمالی از نظر تعداد

آنرمالی از نظر ساختمان کروموزوم ها

تغییر مکان کروموزوم های 1 و 29 در گاو

اسید دزاکسی ریبونوکلئیک

ترکیب شیمیاییDNA 

زنجیره پلی نوکلئوتیدی

مارپیچ دوگانه واتسون و گریک

جایگاه ژنی و الل ها

نحوه بیان ماده ژنتیکی

 -تشکیلmRNA رونویسی

اینترون و اگزون

اپیساژ

سازوکار اپیساژ آلترناتیو

سنتز پروتئین: ترجمه

تغییرات پسا ترجمه ای

رمز ژنتیکی

انتقال مواد ژنتیکی در بین نسل های مختلف

همانند سازیDNA قبل از میوز

مکانیسم همانند سازی

اشتباهات نسخه برداری: جهش های ژنی

مارکر های مولکولی

جهش های نقطه ای

میوز

ترازنامه میوز

بیلان از لحاظ کمی

بیلان از نظر کیفی

نتایج تقسیم میوز از منظر ژنتیکی

تولید مثل و پیش آفرینی

ژن، صفت، فنوتیپ و ژنوتیپ

نقش سه گانه ژن

خلاصه

وضعیت: در حال فروش

فرمت فایل: pdf

صفحات:36صفحه

 زبان : فارسی 


دانلود با لینک مستقیم


اصول ژنتیک مولکولی

دانلود مقاله اثر وزن مولکولی و DD کیتین و کیتوسان روی فرآیند ترمیم زخم

اختصاصی از اس فایل دانلود مقاله اثر وزن مولکولی و DD کیتین و کیتوسان روی فرآیند ترمیم زخم دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

دانلود مقاله اثر وزن مولکولی و DD کیتین و کیتوسان روی فرآیند ترمیم زخم


دانلود مقاله اثر  وزن مولکولی و DD کیتین و کیتوسان روی فرآیند ترمیم زخم

خلاصه :

در این مقاله اثر کیتین و کیتوسان روی فرآیند ترمیم زخم ها و برش های خطی در موش ها بررسی شده است . تحکام شکاف زخم در گروههای کیتوسان (cos),D-glucosamine (GL­c­NAc­­)]   N-acetyl –D-glucosamine و Chiti – aligosaccharide (NACOS) و کیتین ) بیشتر بود .

فعالیت آنزیم های کلاژناز هم در گروه های کیتوسان بیشتر از گروههای کتین است .

میزان تغییرات در مورد تجمع و استحکام و فعالیت آنزیم های کلاژ ناز در نمونه های مختلف زیاد نبود.

دریافته های بافت شناسی رشته های کلاژن به صورت عمود بر خط برش در گروه های (NACOS,COS) رشد کردند و در گروههای کیتوسان تعدادی فیبروبلاست فعال شده در اطراف زخم دیده شد.

در DD های بالا استحکام خط برش ترمیم یافته بیشتر است مچنین سمیزان فیبروبلاست های ظاهر شده اطراف زخم .

مقدمه :

کیتین و کیتوسان تعدادی خواص بیولوژیکی مفید در کاربرد هایی نظیر : 1- پوشش زخم ها 2- زیست سازگاری بالا 3-قابلیت زیست ستخریب پذیری 4- عامل انعقاد خون 5- عامل ضد عفونت 6- عامل تسریع در ترمیم زخم در این تحقیق روی اثر کیتین و کیتوسان روی ترمیم زخم کار شده و بهایننتیجه رسیده که این موارد ست های ترمیم و سلول های (PMN) Polymorphonuclear و فیبروبلاست ها و سلول های اندوتلیال رگ ها را فعال می کنند .

وقتی کیتین و کیتوسان در بدن استفاده می شوند توسط آنزیم های کیتیناز و کیتوساناز خریب می شوند و متعاقباٌ به متومر و الیگومر هایشان تبدیلمی شوند .

شامل 12 صفحه فایل word


دانلود با لینک مستقیم


دانلود مقاله اثر وزن مولکولی و DD کیتین و کیتوسان روی فرآیند ترمیم زخم

نگرشهای مولکولی و فیزیولوژیکی به تحمل خشکسالی

اختصاصی از اس فایل نگرشهای مولکولی و فیزیولوژیکی به تحمل خشکسالی دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

نگرشهای مولکولی و فیزیولوژیکی به تحمل خشکسالی


نگرشهای مولکولی و فیزیولوژیکی به تحمل خشکسالی

نگرشهای مولکولی و فیزیولوژیکی به تحمل خشکسالی

24 صفحه در قالب word

 

 

 

 

 

نگرش های مولکولی و فیزیولوژیکی به تحمل خشکسالی

آب عامل اصلی محدود کننده در کشاورزی جهان می باشد. در کل اغلب گیاهان زراعی، حتی به یک تنش ملایم از دست دادن آب نیز به دشت حساس هستند. با وجود این، چند جنس از گیاهان مختص آفریقای جنوبی وجود دارند که قابلیت بسیار بالا برای مقاومت در برابر از دست دادن آب و خشک شدن را دارند. به این جنس ها، گیاهان قیامت "resurrection Plants" گفته می شود.

ما از Xerophta viscose به عنوان نمونه گیاهان قیامت (تک لپه ای) استفاده کردیم تا ژن های مرتبط با تحمل فشار اسمزی را استخراج کنیم. چندین ژن که بصورت متمایز بیان می شوند، در سطوح بیوشیمایی و ملکولی مورد مطالعه قرار گرفتند. این ژنها همان هایی هستند که قابلیت عملکردی خوبی به اشریشیاکلی در شرایط تنش اسمزی می دهند. ما در این مقاله از این آزمایش به عنوان پایه ای برای بحث درباره نگرش های ملکولی و فیزیولوژیکی به تحل خشکسالی، استفاده خواهیم کرد.

(osmoprotectants)، آبسیزیک اسید (ABA) و عوامل رونویسی

مقدمه:

آب یک جزء مهم و اساسی در متابولیسم تمام ارگانیسم های رانده است. آب، انجام شدن بسیاری از واکنش های حیاتی زیست شناختی را بوسیله دارا بودن خصوصیاتی نظیر حلالیت، فراهم کردن محیط انتقال، سرد کردن محیط از راه تبخیر، تسهیل می کند. (Bohert et al., 1995).

در گیاهان و سایر فتواتوتروف ها، آب نقش مهمی در فراهم کردن انرژی مورد نیاز برای پیشبرد فتوسنتز دارد. ملکولهای آب، طی فرآیندی بنام اتولیز شکسته شده و الکترونهایی بر جای می گذارند که این الکترونها برای به چرخه درآوردن انرژی نوری ذخیره شده در فتوسیستم II ضروری می باشند. (Salisbury an Ross, 1992a)

یکی از پیامدهای مهم تنش خشکی، از دست دادن آب پروتوپلاسمی است که منجر به افزایش غلظت یونهایی مانند  می شود. در غلظت های بالا چنین یونهایی به طور موثری مانع عملکرد متابولیکی می شوند (Hartung et al., 1998). همچنین افزایش غلظت اجزای تشکیل دهنده پروتوپلاسم و از دست دادن آب سلول باعث ایجاد وضعیت خاصی به نام «حالت شیشه ای: glassy state» می شود. در این حالت، ویسکوزیته مایع موجود در داخل سلول بیشتر می شود که در نتیجه باعث افزایش احتمال برهم کنش های مولکولی و واسرشت شدن پروتئین ها و فیوژن غشا می شوند. (Hartung et la., 1998; Hoekstra et al., 2001).

بنابراین گیاه برای حفظ تورگور سلولی و عملکردهای متابولیکی نیاز به بیان ژنهای خاصی دارد. گروه تحقیقاتی ما می کوشد گیاهان تراژنی زراعی و همچنین وحشی را که قادر به مقاوت در برابر خشکی باشند، ایجاد کند. منبع ژنها گیاهی به نام Xerophyta viscose (Baker) از خانواده Vello=iaceae است که متعلق به گروه کوچکی از نهاندانگان می باشد. این گیاه به علت قابلیت فوق العاده تحمل خشکی به «گیاه قیامت» ملقب شده است (Farrant, 2000, Gaff, 1977).

این گیاه (X. viscose) تا 5 درصد محتوای آب نسبی (RWC) می تواند آب از دست دهد و آبیاری مجدد این گیاه تقریباً به مدت 80 ساعت آنرا سیراب کرده و گیاه فعالیت های یزیولوژیکی خود را از سر می گیرد. (Sherwin and Farront, 1998).

ژنهایی که در این مقاله مورد بررسی قرار خواهند گرفت، شامل موارد زیر هستند: (XVPer 1 (کد کننده یک آنتی اکسیدان)، VATP1XV (کد کننده یک پروتئین زیر واحدی C مانند از آنزیم –H+ آدنوزین تری فسفاتاز)، XVGOLS (کد کننده یک گالاکتینول سنتاز)، ALDRXV4 (کد کننده یک آلدوز ردوکتاز)، XVSAP1 (کد کننده یک پروتئین متصل شونده به غشای سلولی) و DREB1A (کد کننده یک عامل رونویسی). برای تعیین اثرات ناشی از بیان این ژنها در تک لپه ای ها، آنها را به گیاه علفی بنام Digitaria sanguinalis انتقال دادیم و برای انتقال این ژنها خودمان یک سیستم انتقال طراحی کرده ایم (chen et al., 1998). سپس اگر نتایج مثبت باشند، ژنها به محصولات زراعی مانند ذرت (Zea mays) نیز منتقل خواهند شد. برای انجام چنین کاری بر روی دو لپه ای ها، ما نخست آن ژن ها را به Arabidopsis thaliana و Nicotina tobacum منتقل می کنیم.

پدیده تحمل خشکی یک پدیده پیچیده است که شامل بیان سازمان یافته ژنهای زیادی است (Walters et la., 2002) به عبارت دیگر، برای بدست آوردن گیاهان مقاوم در برابر خشکی، چند ژن باید به طور همزمان بیان شوند (Co-expression).

به عنوان مثال، بیان XVPer1، که به نظر می رسد DNA را در برابر گونه های فعال اکسیژن محافظت می کند، همزمان با بیان XVSAP1، که احتمالاً از تراوایی غشا جلوگیری می کند، همراه با بیان XVGOLS و ALDRXV4 که هر دو محافظت کننده اسمزی هستند، مجموعه ای از پروتئین های مرتبط به هم را نتیجه می دهد که با همکاری یکدیگر خصوصیت مقاومت در برابر خشکی را نتیجه می دهند.

برخی تغییرات ساختاری و فیزیولوژیکی ایجاد شده در سطح سلولها و در نتیجه در تمام پیکر گیاه از آنجائیکه پاسخ گیاهان به خشکی پیچیده و مختلف است، بنظر نمی رسد که فقط یک ژن در ایجاد تحمل خشکی نقش داشته باشد. بنابراین نیاز به درک پاسخ فیزیولوژیکی گیاهان تحت شرایط کمبود آب از اهمیت خاصی برخوردار است. (رجوع شود به Alpert and Oliver, 2002; Levitt, 1980, Walters et la. 2002 برخلاف گیاهان عادی، که پتانسیل آب را بالاتر از محیط حفظ می کنند و تلاش می کنند به فعالیت خود در دوره های کمبود آب ادامه دهند، گیاهان مقاوم خشکی یک استراتژی کاملاً متفاوت را به کار می گیرند: بافت های زنده تمام آب آزاد خود را از دست می دهند و سپس به طور آنی آب در دسترس بافت ها قرار می گیرد. این توانایی غیرعادی برای بقا در فقدان شدید آب در بافتهای زنده فقط در 100 نهاندانه مشاهده شده است (Gaff, 1977). اگر چه گیاهان قیامت ارزش اقتصادی چندانی برای کشاورزی ندارند، فهم بیشتر این پدیده می تواند نگرشهایی در مکانیسم های ممکن برای بهبود مقاومت گیاهان زراعی، ایجاد کند. در واقع روشهای زیادی وجود دارد که بوسیله آنها گیاهان مختلف به خشکسالی پاسخ می دهند (خلاصه شده در نمودار 1)

 

ممکن است هنگام انتقال از فایل ورد به داخل سایت بعضی متون به هم بریزد یا بعضی نمادها و اشکال درج نشود ولی در فایل دانلودی همه چیز مرتب و کامل است

متن کامل را می توانید در ادامه دانلود نمائید

چون فقط تکه هایی از متن برای نمونه در این صفحه درج شده است ولی در فایل دانلودی متن کامل همراه با تمام ضمائم (پیوست ها) با فرمت ورد word که قابل ویرایش و کپی کردن می باشند موجود است


دانلود با لینک مستقیم


نگرشهای مولکولی و فیزیولوژیکی به تحمل خشکسالی